本发明属于苹果脱毒种苗工厂化繁育技术领域，特别涉及一种高成活率的苹果组培苗两步移栽法；特征在于，包括以下步骤：（1）生根培养；（2）室内炼苗；（3）水草移栽；（4）带水草基质移栽；（5）大田移栽。本发明的有益效果：使用本发明的技术方法，操作技术简单，成本低；炼苗时间短，仅仅需要4天，缩短炼苗时间10‑13天；第一次移栽后，组培苗自养根系生长快，第15天90%以上组培苗自养根系可达1.5cm以上，而且水草保湿性好，拱棚内温、湿度易控制；移栽成活率高，苹果组培苗移栽成活率可达到95.6%以上；两次移栽不伤根系，田间移栽不需要缓苗，苗木生长健壮，可实现当年嫁接；本发明技术方法应用范围广，适用于绝大多数苹果品种。