本发明涉及钻进设备的技术领域，特别是涉及一种湿地碳样钻进取样装置；其无需搭建钻探平台，对湿地上层泥水进行有效隔离，避免对碳样造成污染，提高湿地地下碳样取样效率和取样精度；包括漂浮船、安装于漂浮船上的持地隔水机构和用于地层碳样取样的钻进取样机构，所述持地隔水机构包括上下滑动安装于漂浮船上的存储箱、固定安装于存储箱上的隔离筒、为存储箱上下滑动提供动力的升降驱动器和排泥降水机构，所述钻进取样机构安装于存储箱上，所述排泥降水机构包括上下滑动安装于隔离筒内的浮板、固定安装于浮板上的泥浆泵和连通管，所述连通管的一端与泥浆泵的输出端连通，所述连通管的另一端伸入至存储箱内上部；所述浮板中部设有贯穿孔。