本发明涉及一种土壤深层消毒装置及消毒方法，其中装置包括高压空气压缩机组，发电机组可插入土壤20cm‑60cm的组成矩阵的插头，将压缩空气输送给插头的主管、分配管、支管，每个所述的插头包括本体，本体下端为半个椭圆沿其长轴的旋转体并向后延伸形成的弹头状薄壁壳体，所述半个椭圆的长轴为其半轴的‑倍，薄壁壳体上设置大量的出气孔，本体上端覆盖盖帽，盖帽的顶端设置电极，盖帽的周向外圆上设置进气口，本体的中空腔体内设置电热丝，电热丝与电极相连，每个电极与所述的发电机组并联，每个进气口与支管道相通；主管、分配管和/或支管的管腔内设置电热丝。与现有技术相比，本发明热利用率高，设备简单、操作方便，减少人工成本，提高工作效率。