本发明涉及燃料电池应用技术领域，且公开了一种燃料电池用超高速磁悬浮空压机，包括壳体和动力组件，动力组件位于壳体的内部，所述壳体的两侧分别设有用于压缩气体的进气端和对废气进行利用的膨胀端，所述壳体的圆周内壁从左至右依次通过螺栓固定有卡架、一体化轴承座、固定件一、固定件二、安装环、固定件三、径向磁轴承座和连接架，其中安装环位于壳体的中心部位，安装环的圆周内壁粘接有多个均匀分布的定子，所述卡架和一体化轴承座之间与径向磁轴承座和连接架之间均设有对动力组件转动位置进行检测的检测机构，本发明能够通过压缩轮和膨胀轮同轴的设置，使排出的废气对膨胀轮做功，对废气中气体流动的能量进行回收，减小压缩功耗，实现更高的效率。