本发明涉及基因序列比对技术领域,具体为一种基因组长序列的比对方法、系统、设备和存储介质;为解决现有技术中比对方法准确度较差的问题,本发明首先分别对参考基因组序列和查询序列进行加权syncmer采样处理;然后,明确采样k‑mer序列中seq序列分别在查询序列和参考基因组索引中的开始位置和结束位置,提供准确的位置比对区间;接着,将基于查询结束位置和参考结束位置形成的候选位置集进行成链法处理,得到比对基因序列位置链,反映出基因区域比对结果变化情况;最后,根据需求输出不同对比结果;该方法运用在基因组长序列比对上,能够提高比对准确度、效率和灵活性。 |